De senaste månadssiffrorna från statliga SBAB och bostadssajten Booli visar på en svag nedgång som helhet för bostadsmarknaden, minus 0,1 procent.
Rensat för bland annat säsongseffekter steg dock priserna med 0,7 procent och sedan årsskiftet är uppgången 7,3 procent.
"Tittar man på bostadsprisernas utveckling under en längre tidsperiod ser man en tydlig genomsnittlig negativ säsongseffekt under september månad. De allra senaste åren ser vi dock att den negativa effekten har minskat på lägenhetssidan och att den nu är obefintlig", säger SBAB:s chefsekonom Robert Boije i ett pressmeddelande.
Bland lägenheter syns samtidigt en uppgång med 1,7 procent med prisstegring i fyra av sex regioner. Störst uppgång märks i storstadsregionerna Göteborg och Stockholm och sedan årsskiftet har nu priserna lyft med 9,3 procent.
Detta samtidigt som villapriserna däremot backar. Där märks den största nedgången regionalt sett i södra och norra Sverige.
"Det återstår att se vad ett troligt relativt stort uppdämt behov av att byta bostad betyder för bostadspriserna under årets sista månader, jämfört med det historiskt stora utbudet och normalt negativa säsongseffekter", säger Robert Boije.