Minst 154 av dem har bekräftats smittade av coronaviruset, varav två har avlidit.
20 000 av deltagarna i det religiösa mötet i Lahore har satts i karantän. Men myndigheterna försöker spåra de övriga omkring 80 000 som deltog för att kunna isolera även dem.
– Alla grupper som inte lyder regeringens råd utan fortsätter sina dagliga aktiviteter blir en fara för andra, säger informationsminister Fawad Chaudhry, som riktar kritik mot "de religiösa ledarnas envishet".
Liknande möten i Indien och Malaysia tros ha bidragit till att sprida coronaviruset.
2 818 fall av coronasmittan har registrerats i Pakistan och 41 personer har avlidit i sjukdomen covid-19.