Netanyahu är misstänkt för korruptionsbrott och demonstranterna är ilskna över att han i och med uppgörelsen har lyckats klänga sig fast vid makten.
De omkring 2 000 demonstranterna bar munskydd och gjorde sitt bästa för att hålla avståndsreglerna till följd av coronapandemin
Avtalet, som blev klart i måndags, innebär att Netanyahu behåller premiärministerposten till oktober nästa år, då Gantz tar över. Det bröt ett 16 månader långt politiskt dödläge i Israel, där ingen av sidorna har fått tillräckligt med stöd i Knesset för att bilda regering.