Domstolen i nederländska Haag hänvisar fortsatt utredning till landets egna rättsväsende.
ICC inledde en preliminär förundersökning 2004, där man granskade krigsbrott och brott mot mänskligheten utförda av regeringsstyrkor, paramilitära grupper och rebellgrupper.
Konflikten kunde avslutas efter utdragna förhandlingar mellan centralmakten i Bogotá och Farcgerillan. Parterna enades om fredsuppgörelse 2016. Konflikten fortsätter dock att skapa djupa och polariserande motsättningar i Colombia.
Men ICC:s chefsåklagare Karim Khan sade på torsdagen att Colombia nu "klarar av att leva upp till internationella skyldigheter att utreda och åtala" de skyldiga.
På presskonferensen i Bogotá stod ICC:s åklagare Khan bredvid Colombias nuvarande president Ivan Duque.